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2018年云南大学普通生物学考研提纲和考研笔记（共79页）0 个回复 - 1971 次查看 2018年云南大学普通生物学考研提纲和考研笔记（共79页） 下载地址如下： 内容剪截如下： 普通生物学绪论 一、生物圈 生物和它所居住的环境共同组成生物圈(biosphere)。 地 ...2018-10-19 17:40 - todaytheo - 现金交易版
非理想支化聚合物和理想支化聚合物的约束自由能
未支化的聚合物是相同的
0 个回复 - 4113 次查看 摘要翻译： 我们用降维方法证明了在两平板之间具有排除体积相互作用的支化聚合物在热力学极限下具有与单体数目相同、单体-平板相互作用势相同的理想线性聚合物相同的约束自由能和密度分布。由于分枝引起的凝聚被排除 ...2022-4-12 20:35 - kedemingshi - Forum
0 个回复 - 4113 次查看 摘要翻译： 我们用降维方法证明了在两平板之间具有排除体积相互作用的支化聚合物在热力学极限下具有与单体数目相同、单体-平板相互作用势相同的理想线性聚合物相同的约束自由能和密度分布。由于分枝引起的凝聚被排除 ...2022-4-12 20:35 - kedemingshi - Forum
基于自适应随机的有效自由能剖面重建
扰动协议
0 个回复 - 192 次查看 摘要翻译： Jarzynski非平衡功关系在自由能计算中的应用由于耗散较大时估计的收敛速度很慢而受到限制。本文提出了一种新的扰动协议，该协议能够改善Jarzynski估计在平均力势重构中的收敛性。改进的基础是除热波动引起 ...2022-4-4 18:20 - 可人4 - Forum
0 个回复 - 192 次查看 摘要翻译： Jarzynski非平衡功关系在自由能计算中的应用由于耗散较大时估计的收敛速度很慢而受到限制。本文提出了一种新的扰动协议，该协议能够改善Jarzynski估计在平均力势重构中的收敛性。改进的基础是除热波动引起 ...2022-4-4 18:20 - 可人4 - Forum
P体自由能的大偏差性质
谢林顿-柯克帕特里克模型
0 个回复 - 248 次查看 摘要翻译： 在p体Sherrington-Kirkpatrick模型中，用复制数n为有限的复制方法计算了自由能的累积量母函数phi(n)和速率函数Sigma(f)。从扰动论元出发，我们证明了累积量母函数在n=0附近是常数。另一方面，借助phi(n)的 ...2022-4-2 16:45 - 可人4 - Forum
0 个回复 - 248 次查看 摘要翻译： 在p体Sherrington-Kirkpatrick模型中，用复制数n为有限的复制方法计算了自由能的累积量母函数phi(n)和速率函数Sigma(f)。从扰动论元出发，我们证明了累积量母函数在n=0附近是常数。另一方面，借助phi(n)的 ...2022-4-2 16:45 - 可人4 - Forum
玻璃结构的动力非均匀性特征
自由能极小值
0 个回复 - 359 次查看 摘要翻译： 通过对硬球系统自由能泛函模型的数值最小化，我们发现，在玻璃态自由能最小值处，时均密度场的局部峰的宽度表现出很大的空间变化，类似于动力学非均匀性模拟中的“局部Debye-Waller因子”的变化。从玻璃态 ...2022-3-28 22:55 - 能者818 - Forum
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分子动力学模拟中电荷中心的偏置
经验价键模型：水中过量质子的自由能学
液滴
0 个回复 - 512 次查看 摘要翻译： 多态经验价键(EVB)模型可以准确地描述复杂分子体系中质子转移和溶剂化的能量学，可以有效地用于分子动力学计算机模拟。在这些模型中，运动质子电荷的位置可以由所谓的电荷中心来指定，电荷中心定义为EVB模 ...2022-3-23 17:55 - 大多数88 - Forum
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快速开关自由能计算的最佳偏置
0 个回复 - 200 次查看 摘要翻译： 我们导出了偏置函数，使功偏快开关模拟中计算的自由能差的统计误差最小。以粘性流体中的颗粒为例，将最优偏置函数与其它偏置函数进行了比较。我们的分析表明，当主功值和典型功值都以高频采样时，自由能的 ...2022-3-15 10:20 - 能者818 - Forum
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外场中的三维类伊辛系统：微观
高非高斯近似下自由能的计算
0 个回复 - 262 次查看 摘要翻译： 在$Rho6$模型近似下，导出了均匀外场中三维类伊辛系统临界点附近自由能的解析方法。对温度$T>T_C$($T_C$是无外场时的相变温度）提出的数学描述对$\tilde H_C$附近的场是有效的，其中标度变量为单位量级， ...2022-3-10 08:42 - 可人4 - Forum
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关于自由能的功-哈密顿联系失效的评述
计算
0 个回复 - 239 次查看 摘要翻译： 我们认为，Vilar和Rubi'(cond-mat arxiv:0704.0761v2)关于自由能计算的功-哈密顿联系的明显失败是由于他们对功的错误表示。 --- 英文标题： 《Comment on: Failure of the work-Hamiltonian connection f ...2022-3-8 19:22 - 能者818 - Forum
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蛋白质偶联自由能景观的元模型采样
用蒙特卡罗算法
0 个回复 - 194 次查看 摘要翻译： 元模型是获取复杂系统自由能景观的有力计算工具。Monte Carlo算法已被证明对计算蛋白质简化模型相关的热力学量是有用的，从而获得对蛋白质折叠机制的一般原理的不断增加的理解。我们证明了将元模型学和蒙 ...2022-3-8 10:24 - 能者818 - Forum
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二维XY中自由能的高温展开
模型
0 个回复 - 264 次查看 摘要翻译： 应用有限格方法的改进算法，将二维XY模型的高温自由能级数从原来的$β22阶扩展到$β48阶。得到的长级数使我们可以得出结论，当模型的相变为Kosterlitz-Thouless型时，自由能的行为与预期的一致。 --- 英文 ...2022-3-7 21:49 - 何人来此 - Forum
0 个回复 - 264 次查看 摘要翻译： 应用有限格方法的改进算法，将二维XY模型的高温自由能级数从原来的$β22阶扩展到$β48阶。得到的长级数使我们可以得出结论，当模型的相变为Kosterlitz-Thouless型时，自由能的行为与预期的一致。 --- 英文 ...2022-3-7 21:49 - 何人来此 - Forum
亚稳态在自由能域中的重要性
多肽链
0 个回复 - 246 次查看 摘要翻译： 我们发现，排除体积效应、疏水性和管状多肽链的氢键之间的相互作用产生了自由能景观，这些景观显示出与蛋白质中常见的结构基序相对应的少量亚稳极小值。景观的复杂性只随链的长度适度增加。对这些景观的温 ...2022-3-7 21:07 - nandehutu2022 - Forum
0 个回复 - 246 次查看 摘要翻译： 我们发现，排除体积效应、疏水性和管状多肽链的氢键之间的相互作用产生了自由能景观，这些景观显示出与蛋白质中常见的结构基序相对应的少量亚稳极小值。景观的复杂性只随链的长度适度增加。对这些景观的温 ...2022-3-7 21:07 - nandehutu2022 - Forum
随机有向聚合物问题中的联合自由能分布
0 个回复 - 157 次查看 摘要翻译： 我们考虑了长度为L的随机定向聚合物的两种构型，它们被限制在一个平面上，并以2u相隔的两点结束。定义了两种构型的平均自由能$\bar F$和自由能差F′，利用复制方法确定了联合分布函数P_{L,u}(\bar F,F′) ...2022-3-7 10:49 - 可人4 - Forum
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平均场自旋玻璃自由能的大偏差
0 个回复 - 161 次查看 摘要翻译： 我们用解析方法计算了Sherrington-Kirkpatrick平均场模型的自旋玻璃自由能中大偏差的概率分布，即计算了找到一个强自由能小于最可能系统的指数小概率。这个结果是通过计算配分函数的平均值作为$N$的函数而 ...2022-3-6 20:52 - mingdashike22 - Forum
0 个回复 - 161 次查看 摘要翻译： 我们用解析方法计算了Sherrington-Kirkpatrick平均场模型的自旋玻璃自由能中大偏差的概率分布，即计算了找到一个强自由能小于最可能系统的指数小概率。这个结果是通过计算配分函数的平均值作为$N$的函数而 ...2022-3-6 20:52 - mingdashike22 - Forum
Bethe自由能和Loopy信念下的图Zeta函数
传播
0 个回复 - 516 次查看 摘要翻译： 本文通过建立一个将Bethe自由能的Hessian与边zeta函数联系起来的公式，提出了一种分析循环置信传播(LBP)的新方法。该公式对LBP有一定的理论意义。利用它给出了Bethe自由能的Hessian正定的充分条件，证明了 ...2022-3-6 18:55 - 大多数88 - Forum
0 个回复 - 516 次查看 摘要翻译： 本文通过建立一个将Bethe自由能的Hessian与边zeta函数联系起来的公式，提出了一种分析循环置信传播(LBP)的新方法。该公式对LBP有一定的理论意义。利用它给出了Bethe自由能的Hessian正定的充分条件，证明了 ...2022-3-6 18:55 - 大多数88 - Forum
向列相的对关联函数和自由能泛函
相位
0 个回复 - 197 次查看 摘要翻译： 本文利用平均球面近似(MSA)和Percus-Yevick(PY)积分方程理论，计算了具有长程各向异性相互作用的球形粒子模型在向列相中的对关联函数。MSA理论的结果与Holovko和Sokolovska(J.Mol.Liq.$\bf 82,161（1999） ...2022-3-5 22:44 - 可人4 - Forum
0 个回复 - 197 次查看 摘要翻译： 本文利用平均球面近似(MSA)和Percus-Yevick(PY)积分方程理论，计算了具有长程各向异性相互作用的球形粒子模型在向列相中的对关联函数。MSA理论的结果与Holovko和Sokolovska(J.Mol.Liq.$\bf 82,161（1999） ...2022-3-5 22:44 - 可人4 - Forum
非平衡功数据自由能的贝叶斯估计
仪表噪声的存在
0 个回复 - 217 次查看 摘要翻译： Jarzynski等式和涨落定理将平衡自由能差与功的非平衡测量联系起来。这些关系延伸到探索蛋白质和核酸有限时间热力学的单分子实验。实验误差和仪器噪声的影响以前没有考虑。在这里，我们提出了一种贝叶斯形 ...2022-3-5 17:29 - mingdashike22 - Forum
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正则系综中无序urn模型的自由能
0 个回复 - 277 次查看 摘要翻译： 我们用大数定律计算了无序urn模型的自由能。结果表明，用大数定律得到的鞍点方程与用复制法得到的鞍点方程是相同的。因此，我们得出结论，对于无序的urn模型，复制对称解是足够的。此外，我们还指出了urn ...2022-3-3 21:59 - 可人4 - Forum
0 个回复 - 277 次查看 摘要翻译： 我们用大数定律计算了无序urn模型的自由能。结果表明，用大数定律得到的鞍点方程与用复制法得到的鞍点方程是相同的。因此，我们得出结论，对于无序的urn模型，复制对称解是足够的。此外，我们还指出了urn ...2022-3-3 21:59 - 可人4 - Forum
离轴化学自由能产生的热力学
热液喷口系统及其对分区和
生命的出现
0 个回复 - 155 次查看 摘要翻译： 本文论证了化学自由能是如何通过地质过程产生的。我们提供了一个热力学框架来评估生命是如何在离轴热液喷口系统中出现的；从熵的观点研究了RNA-粘土系统，表明系统在远离平衡态的状态下，通过无机非均相区 ...2022-3-3 21:57 - nandehutu2022 - Forum
0 个回复 - 155 次查看 摘要翻译： 本文论证了化学自由能是如何通过地质过程产生的。我们提供了一个热力学框架来评估生命是如何在离轴热液喷口系统中出现的；从熵的观点研究了RNA-粘土系统，表明系统在远离平衡态的状态下，通过无机非均相区 ...2022-3-3 21:57 - nandehutu2022 - Forum
重建一个机械展开的自由能景观
模型蛋白
0 个回复 - 138 次查看 摘要翻译： 从非平衡的机械展开操作重建了离晶格模型蛋白质的平衡自由能景观作为内部（反应）坐标的函数。这项任务是通过两种独立的方法完成的：使用扩展版本的Jarzynski等式(EJE)和蛋白质固有结构(ISs)。在“折叠转 ...2022-3-3 15:47 - kedemingshi - Forum
0 个回复 - 138 次查看 摘要翻译： 从非平衡的机械展开操作重建了离晶格模型蛋白质的平衡自由能景观作为内部（反应）坐标的函数。这项任务是通过两种独立的方法完成的：使用扩展版本的Jarzynski等式(EJE)和蛋白质固有结构(ISs)。在“折叠转 ...2022-3-3 15:47 - kedemingshi - Forum
自由能计算中功-哈密顿联系的失效
0 个回复 - 290 次查看 摘要翻译： 统计力学的扩展通常被用来从单分子非平衡轨道上所做的功推断自由能。这种方法的一个关键要素是普遍存在的表达式dw/dt=\partial H(x，t)/\partial t，它将随时间变化的力在坐标x上所做的微观功W与在时间t时 ...2022-3-1 22:50 - 何人来此 - Forum
0 个回复 - 290 次查看 摘要翻译： 统计力学的扩展通常被用来从单分子非平衡轨道上所做的功推断自由能。这种方法的一个关键要素是普遍存在的表达式dw/dt=\partial H(x，t)/\partial t，它将随时间变化的力在坐标x上所做的微观功W与在时间t时 ...2022-3-1 22:50 - 何人来此 - Forum
