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分子进化，infoevo，MrBayes，paml,MEGA，生物信息：同济大学学习资料0 个回复 - 642 次查看 分子进化，infoevo，MrBayes，paml,MEGA，生物信息：同济大学学习资料 系统发育树构建原理和常用软件 分子进化，infoevo，MrBayes，paml,MEGA，生物信息：同济大学学习资料 分子进化，infoevo，MrB ...2022-1-22 19:18 - Tiger-like - 现金交易版
R中如何通通系统发育树计算树种之间的距离
1 个回复 - 747 次查看 现在知道249的树种，见附件，如何通过系统发育树，计算它们之间的距离？ 哪位同学知道，请联系我，有酬劳，谢谢2021-12-17 10:58 - xingzhaoh - R语言论坛
1 个回复 - 747 次查看 现在知道249的树种，见附件，如何通过系统发育树，计算它们之间的距离？ 哪位同学知道，请联系我，有酬劳，谢谢2021-12-17 10:58 - xingzhaoh - R语言论坛
没有分支界限的系统发育：缩短短的，修剪短的
深
0 个回复 - 226 次查看 摘要翻译： 我们提出了一种新的系统发生重建算法，与以往大多数严格的推理技术不同，它不依赖于关于分支长度或树深度的假设。该算法返回一个保证包含所有边的森林，这些边是：1）足够长和2）足够靠近树叶，恢复到真树 ...2022-3-26 13:05 - 何人来此 - Forum
0 个回复 - 226 次查看 摘要翻译： 我们提出了一种新的系统发生重建算法，与以往大多数严格的推理技术不同，它不依赖于关于分支长度或树深度的假设。该算法返回一个保证包含所有边的森林，这些边是：1）足够长和2）足够靠近树叶，恢复到真树 ...2022-3-26 13:05 - 何人来此 - Forum
不完全谱系排序：一致的系统发育估计
多位点
0 个回复 - 388 次查看 摘要翻译： 本文介绍了一种在不完全谱系排序的情况下，即当基因树的拓扑结构可能与物种树的拓扑结构不同时，由多个基因树重建系统发生的简单算法。我们证明了我们的技术在标准随机假设下是统计一致的，即在给定足够多 ...2022-3-8 12:23 - 大多数88 - Forum
0 个回复 - 388 次查看 摘要翻译： 本文介绍了一种在不完全谱系排序的情况下，即当基因树的拓扑结构可能与物种树的拓扑结构不同时，由多个基因树重建系统发生的简单算法。我们证明了我们的技术在标准随机假设下是统计一致的，即在给定足够多 ...2022-3-8 12:23 - 大多数88 - Forum
可处理岛屿的海岸线：简约算法和
最小完美系统发育单倍型问题
0 个回复 - 251 次查看 摘要翻译： 问题简约性单倍型(PH)要求最小的单倍型集合来解释给定的基因型集合，而问题最小完美系统发育单倍型(MPPH)要求最小的单倍型集合来允许单倍型嵌入完美系统发育树，这是一个有生物学动机限制的进化树。对于P ...2022-3-6 13:45 - 大多数88 - Forum
0 个回复 - 251 次查看 摘要翻译： 问题简约性单倍型(PH)要求最小的单倍型集合来解释给定的基因型集合，而问题最小完美系统发育单倍型(MPPH)要求最小的单倍型集合来允许单倍型嵌入完美系统发育树，这是一个有生物学动机限制的进化树。对于P ...2022-3-6 13:45 - 大多数88 - Forum
两种嵌套系统发育树的祖先相容性
分类群
0 个回复 - 308 次查看 摘要翻译： 系统发育树的相容性是一个重要的概念，广泛应用于评价不同系统发育树与重叠分类群的一致性，并将它们组合成共同的超级树来揭示生命之树的方法。2004年，Semple等人提出了系统发育树与嵌套分类群祖先相容性 ...2022-3-6 12:18 - 大多数88 - Forum
0 个回复 - 308 次查看 摘要翻译： 系统发育树的相容性是一个重要的概念，广泛应用于评价不同系统发育树与重叠分类群的一致性，并将它们组合成共同的超级树来揭示生命之树的方法。2004年，Semple等人提出了系统发育树与嵌套分类群祖先相容性 ...2022-3-6 12:18 - 大多数88 - Forum
Phylogrid：系统发育中工作流的开发
0 个回复 - 186 次查看 摘要翻译： 在这项工作中，我们提出了一个基于Taverna的工作流的开发，该工作流将通过MrBayes工具来实现系统发育计算。它具有使用Gridsphere框架开发的友好界面。用户可以定义进行贝叶斯计算的参数，确定进化模型，在 ...2022-3-4 08:47 - kedemingshi - Forum
0 个回复 - 186 次查看 摘要翻译： 在这项工作中，我们提出了一个基于Taverna的工作流的开发，该工作流将通过MrBayes工具来实现系统发育计算。它具有使用Gridsphere框架开发的友好界面。用户可以定义进行贝叶斯计算的参数，确定进化模型，在 ...2022-3-4 08:47 - kedemingshi - Forum
想请大神回答一下系统发育特征向量分析（PVR）的问题
0 个回复 - 1132 次查看 我想基于系统发育特征向量回归（PVR）分析系统发育对植物某一特征的影响，利用主坐标分析（pcoa）求出了系统发育距离矩阵的特征向量，目前遇到的困难是不知道从中提取哪几个特征向量进行分析，如图，我看到论文里写要 ...2020-7-22 16:06 - 重于珠玉 - R语言论坛
0 个回复 - 1132 次查看 我想基于系统发育特征向量回归（PVR）分析系统发育对植物某一特征的影响，利用主坐标分析（pcoa）求出了系统发育距离矩阵的特征向量，目前遇到的困难是不知道从中提取哪几个特征向量进行分析，如图，我看到论文里写要 ...2020-7-22 16:06 - 重于珠玉 - R语言论坛
