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R {glmnet} package异常 求指点
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求帮助, 周一开始用
glmnet package 里的function就开始回error. 我是windows, 试了R3.1.3 和3.2.0两个版本都不行,试了家里有另一部苹果机,可以。 试的语句很简单,最后dim那句一打出来就是弹出一个source viewer窗 ...
2015-5-2 00:24 - yinshf_04 - R语言论坛
R语言glmnet中的cox回归)
15 个回复 - 25305 次查看
> library("
glmnet")
> library("survival")
> data dim(data)
[1] 560 18
> head(data)
time status hsa.miR.198 hsv1.miR.H1 GALNT10 KLHDC3 MGC3196 PPM2C
1 1336 0 6.000120 7.11 ...
2014-6-8 11:55 - 相逢一笑0206 - 爱问频道
求助! cv.glmnet运行报错
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之前运行是可以的,这次换了一份数据,就报错了,但是没找到原因,求大神解答,谢谢!
Warning message:
Option grouped=FALSE enforced in cv.
glmnet, since < 3 observations per fold
2022-1-12 19:45 - 櫈补櫈 - R语言论坛
求教:关于glmnet()的预测函数问题
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目前对于一个三分类问题,首先使用
glmnet训练处了模型fit1,之后使用predict函数,输入fit1和x_test进行预测。得到的分类结果与使用贝叶斯分类公式写的预测函数并不一致,因此想请教一下各位大佬,是不是由于predict ...
2021-6-6 12:24 - javen123 - R语言论坛
利用glmnet函数实现岭回归与Lasso
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利用
glmnet函数实现岭回归和Lasso#Hitters(棒球)数据集介绍library(ISLR)names(Hitters)#[1] "AtBat" "Hits" "HmRun" # [4] "Runs" "RBI" "Walks" #[7] "Years" "CAtBat" "CHits ...
2019-1-29 21:56 - hylnwoau - R语言论坛
R软件glmnet包lasso-cox
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楼主可以使用R的
glmnet包做lasso-cox的模型,cv.
glmnet得到lambda.min,之后coef能得到beta系数,但是spss模型会有每个系数的P值,这个包能得到这个p值,以及其他模型相关的指标?超级感谢~
2018-11-28 16:19 - 凌1975 - 爱问频道
glmnet包程序问题,lasso算法
2 个回复 - 4224 次查看
输入数据后,我的程序是cv.
glmnet(x,y,family="binomial",type.measure="auc"),运行后,出现警告,too few observations per fold for type.measure.auc in cv.lognet,changed to type.measure=deviance
,a ...
2017-2-12 10:32 - gffly - R语言论坛
GLMNET结果如何保存起来供下次分析用
3 个回复 - 2293 次查看
这里问个小白问题,大侠帮个忙。网上找了半天,没找到解决方案。
我用GLMNET函数获得一个模型glm.fit, 之后就可以用predict(glm.fit, new.x, s = lambda)来预测结果。
可是如果我生成模型后,不想每次预测都要重 ...
2017-1-10 17:22 - windy0704 - R语言论坛
如何用R中glmnet包确定λ?lasso-logistics回归
0 个回复 - 2608 次查看
各位大神!小弟最近用R的
glmnet包做lasso回归,预测结果不好,不知道是程序 的问题还是方法的问题,特把程序发在这里,请大家看看有没有问题,k-fold cross-validation选择了lambda,然后选择最小的lambda来回归预测 ...
2016-11-10 03:12 - 安徒生彤话 - 爱问频道
glmnet计算决定系数
1 个回复 - 5666 次查看
最近在学习
glmnet包,今天看到一个有关
glmnet中cox回归决定系数计算的方法。
参考文献http://www.doc88.com/p-6981133719365.html。
计算公式为R-square(R2)=1-exp{-2 [ L(β)-L(0) / n] },其中L(·)是对数似然 ...
2015-4-15 18:17 - 相逢一笑0206 - R语言论坛
求助,关于glmnet提示错误!
5 个回复 - 6908 次查看
最近在学习用
glmnet,在用
glmnet实现cox惩罚回归时,对照例子改了代码,但是老提示错误,错误内容是:
提交这句后
> cv.fit 0) and 'status' (binary) as a response; a 'Surv' object suffices
但是我明明已经定 ...
2011-5-29 18:07 - baoaibaobao - R语言论坛
请教:R软件包glmnet中的cv.glmnet函数运行出错(详见如下的自带程序)
4 个回复 - 13432 次查看
library(
glmnet)
set.seed(1010)
n=1000;p=100
nzc=trunc(p/10)
x=matrix(rnorm(n*p),n,p)
beta=rnorm(nzc)
fx= x[,seq(nzc)] %*% beta
eps=rnorm(n)*5
y=drop(fx+eps)
px=exp(fx)
px=px/(1+px)
ly=rbino ...
2015-1-3 23:07 - tjxxukai - R语言论坛