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关于热力图(heatmap)的绘制的问题
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在网上学习了快一天了,看了几个现成做热力图的软件,但是做出来不是很好看,还有一个用excel做的,也是有点麻烦,并且难看,最终锁定在用R语言来进行绘制。
网上看到的代码和教程对于零基础的我来说,不知道怎 ...
2017-2-26 15:44 - guangoucun - 悬赏大厅
Instant Heat Maps in R How-to
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About This Book
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[*]Create heat maps in R using different file formats
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2015-3-1 12:48 - Lisrelchen - winbugs及其他软件专版
pheatmap怎么把显示的变量名改为变量标签
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大家好,请教一个问题。我用pheatmap做热图,变量名按照R取名规则写的,比如Trans.AR, Tys.Typ.....
但是在图形中,我希望把变量名显示为专业的名词,比如Trans.AR修改为Trans/AR,Tys.Typ修改为Type-Typ,请问应 ...
2018-8-31 11:44 - pingguzh - R语言论坛
求助:heatmap定义颜色
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用R软件的heatmap画热图时,对整个图的颜色可以定义,按照设定的色标变化。但是我的问题是,我想对数据中比如0这样的值的颜色定义成一种特殊的颜色比如黑色,而其他大小的值还按照色标来变化比如从蓝到红。heatmap中 ...
2016-4-19 09:38 - CARAWAY - R语言论坛
heatmap.2 reorderfun labrow
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最近在学习R里面的heatmap.2,有些地方搞不明白,希望有热心网友指导下:1.在heatmap.2函数的帮助页面有如下例子
## Reorder dendrogram by branch means rather than sums
heatmap.2(x, reorderfun=function(d, ...
2015-8-12 14:58 - Mr.circle - R语言论坛
用pheatmap package 绘制热图的疑问
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这个是我绘制的一个热图,但是怎么样调整图注中的尺度(本图是-3,-2,-1,0,1,2的渐进)能否调成-3一下都是统一绿色,2以上统一红色?或者能否在渐进色不变的情况下自己调整图注的尺度?(改成-4,-3,-2,-1,0,1,2) ...
2015-1-8 21:53 - 志远学R语言 - R语言论坛
R语言绘制heatmap图
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我想将这些样本进行聚类分析,从数据进行聚类,看是否通过这些数据可将样本分成几类,不知怎样做,并且不知怎样将样本分好的类用不同的颜色表示patientcolors,请各位大神赐教!
library("ALL")
library(gplots)
...
2013-9-5 09:39 - wangying2121 - R语言论坛
问题,pheatmap和heatmap.2结果不一样
4 个回复 - 13021 次查看
对同一组数据聚类时发现,pheatmap和heatmap.2结果不一样,差别很大?是什么原因呢?
pheatmap(data, cluster_cols=FALSE,clustering_distance_row="correlation",clustering_method = "complete",color=colorRampP ...
2012-10-9 17:08 - gaoyu_8848 - R语言论坛